След 2000-та година площта на националните паркове не е променяна
МОСВ припомня, че през 1998 г. е приет и влиза в сила Закона за защитените територии (ЗЗТ), с който в България се въвежда класификация на защитените територии съгласно международните норми (категоризацията на международния съюз за защита на природата- IUCN). В съответствие с новата класификация, съществуващите към онзи момент защитени територии, в зависимост от предмета и целите на опазването им, са прекатегоризирани. В изпълнение на разпоредбите на ЗЗТ, през 1999 г., със заповеди на министъра на околната среда и водите, трите Народни парка „Рила”, „Централен Балкан” и „Пирин”, са прекатегоризирани в „национални паркове“ и са изключителна държавна собственост. Те са с обща площ от 193 047,9 хектара. Същата година, Народното събрание приема решение, с което част от НП „Рила“ се прекатегоризира в „Природен парк „Рилски манастир“. Земята е с площ от 27 370.7 ха и собствеността й е възстановена на Рилската Света обител. В резултат на това, към края на 2000 г., общата площ на националните паркове възлиза на 150362.3 ха.
След 2000-та година площта на националните паркове не е променяна.
В изпълнение на решението на Народното събрание, с Плана за управление на Природен парк „Рилски манастир“, се въвеждат режими за опазване и ползване, валидни за националните паркове. Създадена е и специализирана Дирекция за управление и изпълнение на плана за управление на природния парк към Изпълнителна агенция по горите.
През 1990 г. площта на защитените територии възлиза на 227 172 ха, което съставлява 2% от територията на страната, а към 2013 г. защитените територии са вече 1010 с обща площ 584 607 ха, която е 5.3% от територията на България.